A PMSE possui não só unidades operacionais como também unidades administrativas que operam para administrar e dar suporte aos mais diversos serviços que a PMSE executa. Porém em casos excepcionais também podem ser usadas no emprego operacional.

Unidades Administrativas

ALMOXARIFADO
ALMOXARIFADO

Almoxarifado Geral

CFAP
CFAP

Centro de Formação e Aperfeiçoamento de Praças

Corregedoria
Corregedoria

Corregedoria da PMSE

CSM
CSM

Centro de Suprimento e Manutenção

GGCC
GGCC

Gabinete de Gestão de Crises e Conflitos

HPM
HPM

Hospital da Polícia Militar

MPMSE
MPMSE

Museu da Polícia Militar

SMCOM
SMCOM

Seção de Manutenção e Comunicação

PRESMIL
PRESMIL

Presídio Militar